Se le piante sono sane (niente oidio, virosi etc), hai impollinato manualmente e non hai ecceduto coll'acqua, è carenza di calcio nel terreno.
Tieni comunque conto che se la pianta sta producendo (sia che i frutti alleghino bene o meno) da oltre un mese, la resa tende a calare e gli "aborti spontanei" tendono ad aumentare e non ci si può fare nulla.