A quel che ho letto più volte, la morte improvvisa di una Passiflora è sempre preceduta da sintomi ai quali spesso non si fa caso: colore leggermente più chiaro delle foglie, nervature che risultano più evidenti e, con le temperature estive di quest'anno, qualche foglia che appassisce alla base.
Tu parli di ruggine sul tronco e sarebbe stato interessante poterne vedere una foto, soprattutto sotto la corteccia, perché per alcune affezioni mostra dei sintomi della patologia.
Infatti ecco come si presentano il tronco scortecciato e i rami tagliati di una pianta morta improvvisamente a causa del
Fusarium oxysporum f. sp. passiflorae (il colletto all'esterno "inbrunisce" e appaiono delle fessurazioni verticali)
.
Ovviamente è una mia idea e occorre attendere il parere di un esperto ma, precauzionalmente, ti consiglierei comunque di disinfettare gli attrezzi eventualmente utilizzati per la pianta prima di utilizzarli su altre piante.