No no, anzi, se aspetti la primavera è tropo tardi, e la margotta potrebbe morire durante l'inverno. Fai conto che è un po' come un rinvaso o un trapianto, se lo fai in settembre hai ancora più di un mese prima che perda le foglie, quindi ha tutto il tempo per ambientarsi. Può anche darsi che le perda prima, ma se rimane tutto ben riparato durante l'inverno vedrai che in primavera metterà nuove foglie. al limite potrebbe andar bene anche ottobre, ma non andare oltre.
L'importante è che quando la stacchi metti il tutto in un vaso bello largo cercando di lasciare intatto il pane di terra con le radici, e poi il vaso lo riparerai durante l'inverno coprendolo ad esempio con foglie secche o altro in modo da isolarlo un po' dal gelo.