La radice è solo un fatto estetico, solo che in genere nei bonsai si preferisce avere una base con radici radiali che escono in tutte le direzioni (perchè simula un vecchio albero secolare), mentre quella esce dal terreno e sale, per poi tornare a piantarsi, ma se ti piace fai bene a lasciarla, potrebbe essere considerato un segno di originalità (e ogni scarrafone è bello a mamma sua).
Riguardo alla potatura puoi farla anche adesso. Se vuoi uno stile a scopa rovesciata allora dovrai lasciare una chioma semi sferica, altrimenti dovrai darle triangolarità, lasciando quindi un apice appuntito (o comunque con punta arrotondata) e una chioma che si allarga man mano che scende, perciò taglierai di più i rami alti e di meno o nulla quelli bassi. Solo che una chioma trinagolare presuppone anche rami a quote diverse (più lunghi quelli in basso e via via più corti) e il primo ramo dovrebbe partire a un terzo dell'altezza (nell'attuale tronco invece i rami stanno tutti in alto, perciò sarebbe più indicato una scopa rovesciata). Ma nulla vieta che in futuro possano partire anche rami più in basso, dipende da te. Sappi solo che per ingrossare un ramo devi lasciarlo crescere, per poi tagliarlo solo dopo che ha raggiunto il diametro voluto.